Para impulsar los procesos de investigación participativa, la ANAFAE utilizó dos modalidades; en la primera, se contó con una metodología conocida como Escuelas de Campo y en la segunda se estableció un fondo para investigación; cada uno se explica a continuación.

3.1 Escuelas de campo (ECA).

La metodología de ECA promueve la capacitación participativa, es una forma de enseñanza-aprendizaje fundamentada en la educación no formal donde productores(as) y facilitadores(as) intercambian conocimientos y se fortalecen mutuamente. La metodología surge a finales de los ochenta en Indonesia, con el propósito de impulsar el manejo integrado de plagas (MIP) en el cultivo de arroz y camote, posteriormente es aplicada en otros países como Nepal, logrando buenos resultados en el fortalecimiento de capacidades y generación de alternativas de manejo de plagas. (Gonsalves et al. 2006)

En la región, la metodología de ECA es introducida en el año 2000 por el Programa de Manejo Integrado de Plagas con Productores en América Central (PROMIPAC), que desarrolla trabajos en Nicaragua y El Salvador.

En Honduras la ANAFAE aplica la metodología en el 2004, iniciando procesos en la región de centro occidente en donde el cultivo de papas y hortalizas son prioritarios para los productores, posteriormente en el 2005 se aplica la metodología en las regiones del sur y norte del país.

La ECA se basa en principios metodológicos y técnicos que concuerdan con el pensamiento y que hacer agroecológico de ANAFAE; ya que se basa en el concepto de aprender por descubrimiento y su corazón o parte central es el análisis del agroecosistema ó agroecológico (AAE), que busca fortalecer la capacidad analítica tomando en cuenta la información de todos los factores relacionados en un sistema productivo.

Existen principios, que son la base de aplicabilidad de la metodología en diferentes temáticas y que fortalecen la visión de los procesos de investigación participativa, los principios metodológicos son los siguientes:

• El campo es la primera fuente de aprendizaje: en este contexto es donde los agricultores se sienten a gusto, ya que de manera práctica es donde han aprendido a relacionar los efectos de diferentes prácticas en su parcela, cultivos y ambiente; es donde han conocido las relaciones entre el suelo, las plantas, los insectos, los animales, el clima, etc.; en resumen es donde vive y trabaja el o la  productora.
• La experiencia es la base para aprender: el proceso de capacitación está basado principalmente en la práctica. Durante la capacitación es importante que el agricultor realice pruebas o experimentos  a los cuales también se llaman “estudios específicos”, para ganar conocimientos y experiencia. Al mismo tiempo se debe tomar en cuenta la experiencia de los(as) participantes, la cual es compartida para buscar alternativas en los problemas prioritarios.
  
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